RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00477Q96M19 166 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 NAGKQ9UJ70 344 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5G1P05496 136 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5G3P48201 142 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-214ENST00000583153 SSX7Q7RTT5 188 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-214ENST00000583153 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-214ENST00000583153 SNURFLB1AK76 121 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 F6UZH7 168 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 M0R2N4 97 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 GAGE7O76087 117 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 Q0VG73 95 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF492Q9P255 531 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPQ1 181 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 G0S2P27469 103 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 Q8TAT8 98 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YY99 117 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 NACAE9PAV3 2078 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRM-214ENST00000583153 NPSP0C0P6 89 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-214ENST00000583153 MUC21Q5SSG8 566 aa5.84□□□□□ -1.47
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