RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMS2P0C7Q2 107 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM88Q6PEY1 159 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 APLNQ9ULZ1 77 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 P01737 135 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCRT2Q9NQ03 307 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-53P01767 116 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED14OSP0DP75 135 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2D3Q8NGH3 330 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS20P60866 119 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 POM121L12Q8N7R1 296 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT10Q8NFP7 164 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT11Q96G61 164 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01551Q86U37 167 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C5Q8NGB2 326 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKRY2A2RUG3 117 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT8Q8NBV8 401 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF479Q96JC4 524 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf53Q8NAA6 179 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NACAE9PAV3 2078 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa23.21■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DMRTA1Q5VZB9 504 aa23.2■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM231DQ6ZW35 169 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RS1O15537 224 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP126Q5VTH2 177 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP82Q8N141 532 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BNG1 76 aa23.18■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT8Q9UHE5 227 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRO0255Q9UI72 69 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YY99 117 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R381 172 aa23.17■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE6AA0A183 80 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVFC1-1P60608 527 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYSTQ99698 3801 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLC6P0CF74 106 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa23.15■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VSIG2Q96IQ7 327 aa23.14■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS9CQ6DKI2 356 aa23.13■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GATCO43716 136 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT3O95989 172 aa23.13■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TPPP3Q9BW30 176 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPQ1 181 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP2Q6ZN57 461 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISOC2Q96AB3 205 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFRP2Q96HF1 295 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 JPT2Q9H910 190 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSTCQ9NRP0 149 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 F2Z2F3 143 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADIRFQ15847 76 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 LY6G6CO95867 125 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT83Q5H943 113 aa23.09■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa23.08■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MWL6 223 aa23.07■■□□□ 1.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf54Q8N8G6 183 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD10Q9BYL1 202 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 UFSP1Q6NVU6 142 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTRLP40313 264 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNG7P62955 275 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYZL1Q6UWQ5 148 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSTP61278 116 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM74A4Q5TZK3 123 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICOSQ9Y6W8 199 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A096LPF7 62 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa23.03■■□□□ 1.28
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