RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-208	ENST00000563857	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	PDE6D	O43924	150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	SH2D1A	O60880	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	GYPE	P15421	78 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	RHOH	Q15669	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	RHOD	O00212	210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	CXCL1	P09341	107 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857		K7EQD1	137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	SIVA1	O15304	175 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	TIRAP	P58753	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-208	ENST00000563857		M0R036	132 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	NXPH4	O95158	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	CRIP1	P50238	77 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857		H3BVH4	76 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	RTL8C	O15255	209 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	BCL2	P10415	239 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	CCL20	P78556	96 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	EVI2A	P22794	236 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	GNG4	P50150	75 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	PARL	Q9H300	379 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RNPS1-208	ENST00000563857		A0A087WWC5	75 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857		M0R381	172 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	TMEM250	H0YL14	139 aa		11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	EREG	O14944	169 aa		11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	LELP1	Q5T871	98 aa		11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857		F2Z2F3	143 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	SNAI2	O43623	268 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857		P01737	135 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	SMIM17	P0DL12	118 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.99	□□□□□ -0.65

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