RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 RS1O15537 224 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 ASIPP42127 132 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 SLAQ13239 276 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB5CP51148 216 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.2□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF575Q86XF7 245 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 UPK3BQ9BT76 320 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 DERL1Q9BUN8 251 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.19□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 SRIP30626 198 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 PRR27Q6MZM9 219 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 Q6ZSN1 163 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.18□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 C6orf223Q8N319 242 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.17□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 MLST8Q9BVC4 326 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 IL36BQ9NZH7 164 aa10.17□□□□□ -0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 SFRP2Q96HF1 295 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 CRYGDP07320 174 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.09□□□□□ -0.79
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