RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	OTOS	Q8NHW6	89 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM203	Q969S6	136 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SDF2	Q99470	211 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	RERGL	Q9H628	205 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	EML5	Q05BV3	1969 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CASZ1	Q86V15	1759 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LRP5	O75197	1615 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	GRIN2A	Q12879	1464 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	MBD5	Q9P267	1494 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		A0A0G2JMM0	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1W2PPB8	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1W2PRS3	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		A6NIN4	97 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PYY	P10082	97 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CCL4	P13236	92 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	S100A1	P23297	94 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SELENOW	P63302	87 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	EMX2	Q04743	252 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SPCS2	Q15005	226 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LINC01545	Q5VT33	79 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	C12orf57	Q99622	126 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CGREF1	Q99674	301 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LIMD2	Q9BT23	127 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	WDR97	A6NE52	1622 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PARP14	Q460N5	1801 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CUL7	Q14999	1698 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		F6UZH7	168 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SNAPC5	O75971	98 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SNCG	O76070	127 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	IGKC	P01834	107 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	APOD	P05090	189 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	IL7	P13232	177 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ADCYAP1	P18509	176 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	FXYD6P3	P58550	94 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	CSAG1	Q6PB30	78 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843		Q6ZUT4	128 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	DPH3	Q96FX2	82 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	C14orf144	Q96I85	54 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SEC11C	Q9BY50	192 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	SCN3B	Q9NY72	215 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	GNG8	Q9UK08	70 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	DOCK2	Q92608	1830 aa		0.41	□□□□□ -2.34
COPS2-205	ENST00000558843	ADGRB1	O14514	1584 aa		0.4	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms