RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557147.1

LINC01578-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, human

TSL 3 BASIC

Gene LINC01578, Length 490 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01578-208	ENST00000557147	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	RS1	O15537	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	RAB5C	P51148	216 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC01578-208	ENST00000557147	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	SULT1A2	P50226	295 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147		Q8N1X5	172 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	PPT1	P50897	306 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	RHOH	Q15669	191 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	CRYGD	P07320	174 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147		A0A087WTM6	91 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	IFNA7	P01567	189 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	HSPG2	P98160	4391 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC01578-208	ENST00000557147	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	FAM74A7	A6NL05	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147		A8MWV9	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	PEX7	O00628	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	UBE2G2	P60604	165 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	LELP1	Q5T871	98 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	ASIP	P42127	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147		A0A1B0GV50	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147		Q86TA4	180 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	PARL	Q9H300	379 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC01578-208	ENST00000557147	PAGE4	O60829	102 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147		B4DEV8	164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	LAGE3	Q14657	143 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	RHOD	O00212	210 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	PSCA	O43653	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	CRIP1	P50238	77 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	CCL20	P78556	96 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	UBE2G1	P62253	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147		Q6ZSN1	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC01578-208	ENST00000557147		A0A087WWC5	75 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms