RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TOR2AQ5JU69 321 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PTH2Q96A98 100 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 WFDC1Q9HC57 220 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PSG8Q9UQ74 426 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GGTLC3B5MD39 225 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 K7EQM0 130 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 TCRAP04437 139 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ZFP69Q49AA0 526 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 LINC01620Q4KN68 170 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 SMUG1Q53HV7 270 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 BAALCQ8WXS3 180 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 PRNTQ86SH4 94 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 C5orf17Q8NAS9 161 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 S100ZQ8WXG8 99 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 PARLQ9H300 379 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SSNA1O43805 119 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SCXQ7RTU7 201 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 OR2T35Q8NGX2 323 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 COX11Q9Y6N1 276 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 A8MWV9 139 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 A0A087WWC5 75 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 UPK1BO75841 260 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 IGLV2-11P01706 119 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 STAG3L2P0CL84 134 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 STAG3L3P0CL85 134 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 Q8N976 141 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 RMI2Q96E14 147 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 Q9UF83 564 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 EPDR1Q9UM22 224 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 LINC00694P0DN24 101 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 GCHFRP30047 84 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SYT8Q8NBV8 401 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 JPT2Q9H910 190 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 RAB24Q969Q5 203 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-214ENST00000548849 RNF222A6NCQ9 220 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 ASIPP42127 132 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 IFITM3Q01628 133 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 SUN5Q8TC36 379 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 LINC00479Q96M42 142 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 KLK12Q9UKR0 248 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 SEC11BP0C7V7 166 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 NIT1Q86X76 327 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 UBE2WQ96B02 151 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 H3BVH4 76 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 CXorf1O96002 111 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 OXTP01178 125 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 IL36BQ9NZH7 164 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 A0A087WX48 190 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 B4DEV8 164 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 MBP02144 154 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 ATP6V0CP27449 155 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 RHODO00212 210 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 ELOBQ15370 118 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-214ENST00000548849 A0A087WWL8 130 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.8 ms