RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 IGKV1-5P01602 117 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 UBE2BP63146 152 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 WFDC2Q14508 124 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 LINC00311Q8N616 119 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.8□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 H3BMG7 143 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.79□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 NMSQ5H8A3 153 aa6.79□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.79□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 USP24Q9UPU5 2620 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 H3BUA1 57 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 OSTCQ9NRP0 149 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 A8MWV9 139 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 PDE6HQ13956 83 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 GGTLC3B5MD39 225 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 H3BMM0 161 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 SLURP1P55000 103 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLIP1-218ENST00000545889 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.78□□□□□ -1.32
CLIP1-218ENST00000545889 K7ERJ3 54 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 NCR2O95944 276 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 ATP5G1P05496 136 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLIP1-218ENST00000545889 SH2D1AO60880 128 aa6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.76□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.76□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LINC00310P59036 64 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLIP1-218ENST00000545889 MGST2Q99735 147 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLIP1-218ENST00000545889 DPM2O94777 84 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 C20orf78Q9BR46 151 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 SPXQ9BT56 116 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 K7EMI3 77 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 INSL3P51460 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 LAGE3Q14657 143 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLIP1-218ENST00000545889 ZNF134P52741 427 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLIP1-218ENST00000545889 Q6ZRM9 215 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 THAP8Q8NA92 274 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 F8W735 103 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 TNFRSF6BO95407 300 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 RHOHQ15669 191 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 DEFB135Q30KP9 77 aa6.75□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 C8orf49Q96NF6 230 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-218ENST00000545889 DMDP11532 3685 aa6.74□□□□□ -1.33
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