RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542953.1

NPIPB3-211, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B3, humanhuman

TSL 4

Gene NPIPB3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB3-211ENST00000542953 TAS2R45P59539 299 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 GNG5P63218 68 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ZNF726P1Q15940 193 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TDRG1Q3Y452 100 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 KHDC3LQ587J8 217 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 MUC21Q5SSG8 566 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TMED6Q8WW62 240 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 RAB24Q969Q5 203 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 HYLS1Q96M11 299 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 MED28Q9H204 178 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.15□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 A0A1W2PPV4 95 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 GGTLC3B5MD39 225 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CRYGDP07320 174 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 GCHFRP30047 84 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CSN1S1P47710 185 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CRYBA4P53673 196 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 WFDC2Q14508 124 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 RASL10AQ92737 203 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ZNF479Q96JC4 524 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SGK494Q96LW2 274 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.14□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 F6UZH7 168 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TCRAP04437 139 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TYMSP04818 313 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SFTA3P0C7M3 94 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SERF2P84101 59 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ZNF415Q09FC8 603 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ODF1Q14990 250 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LINC00479Q96M42 142 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SPXQ9BT56 116 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TREM1Q9NP99 234 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 PRO0255Q9UI72 69 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 EPDR1Q9UM22 224 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 PSG8Q9UQ74 426 aa3.13□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 A0A1W2PRE2 83 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SMLR1H3BR10 107 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 K7EQD1 137 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 M0R2P5 195 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 GCGP01275 180 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 MBP02144 154 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CRIP1P50238 77 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SLAQ13239 276 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 RNF151Q2KHN1 245 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LINC01620Q4KN68 170 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ASB13Q8WXK3 278 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 C9orf85Q96MD7 179 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 LINC01600Q96MT4 127 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 NAGKQ9UJ70 344 aa3.12□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.11□□□□□ -1.91
NPIPB3-211ENST00000542953 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms