RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PPV4 95 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 TAS2R45P59539 299 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 LELP1Q5T871 98 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 Q6ZSA8 131 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRU-210ENST00000527027 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.7□□□□□ -0.7
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PTPRU-210ENST00000527027 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.69□□□□□ -0.7
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PTPRU-210ENST00000527027 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRU-210ENST00000527027 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE12JA6NER3 117 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 OXTP01178 125 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 GCGP01275 180 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 RAB14P61106 215 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE1Q13065 139 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE4Q13068 117 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE5Q13069 117 aa10.58□□□□□ -0.72
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