RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	JMJD1C	Q15652	2540 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CKS1B	P61024	79 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WX48	190 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		K7EMI3	77 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PAX4	O43316	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CEND1	Q8N111	149 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	MAL	P21145	153 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB130B	P0DP73	79 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB130A	P0DP74	79 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		Q8NA96	180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RASL10A	Q92737	203 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf70	A6NJV1	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		I3L3M4	83 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-59	P01825	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CFHR3	Q02985	330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM141	Q96I45	108 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK8	P0C7L1	97 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE4	Q13068	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE5	Q13069	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DSCAM	O60469	2012 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	SIVA1	O15304	175 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		J3QQQ9	107 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GATA3	P23771	443 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GXF2	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM86B	Q8N661	226 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	RHOD	O00212	210 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CRP	P02741	224 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	FGF6	P10767	208 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	VWC2L	B2RUY7	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	FXYD2	P54710	66 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		F8W1H4	67 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TAX1BP3	O14907	124 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB136	Q30KP8	78 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PTPRS	Q13332	1948 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01619	G3V211	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TAL2	Q16559	108 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.22	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01548	A6NM66	108 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE7	O76087	117 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CTRL	P40313	264 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.21	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	NRGN	Q92686	78 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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