RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL36B	Q9NZH7	164 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-223	ENST00000512131		B4DEV8	164 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3-53	P01767	116 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	MED14OS	P0DP75	135 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLA	Q13239	276 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0J9YY99	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R036	132 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUDT3	O95989	172 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV2-8	P01709	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASIP	P42127	132 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF876P	Q49A33	203 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM12	Q96EX1	92 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	MED9	Q9NWA0	146 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYBA4	P53673	196 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CENPW	Q5EE01	88 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131		C9JCJ5	164 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A096LPF7	62 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	RS1	O15537	224 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXCL1	P09341	107 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSPG2	P98160	4391 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BVH4	76 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAX4	O43316	350 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CIDEA	O60543	219 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNG4	P50150	75 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCL18	P55774	89 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTL8C	O15255	209 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		A8MWV9	139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ESRG	Q1W209	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PARL	Q9H300	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		K7EQD1	137 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNAI2	O43623	268 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZR54	194 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	NXPH4	O95158	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	JPT2	Q9H910	190 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R2N4	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GYPE	P15421	78 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		K7EN84	100 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZSN1	163 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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