RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL1P09341 107 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 GLRXP35754 106 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 RAB5CP51148 216 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ARPP19P56211 112 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCBD2Q9H0N5 130 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 DLG5Q8TDM6 1919 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 FLNCQ14315 2725 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MTORP42345 2549 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 PFDN1O60925 122 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CDK6Q00534 326 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MUCL1Q96DR8 90 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 M0R233 179 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BKO60814 126 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BJP06899 126 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB124Q8NES8 71 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 BORCS5Q969J3 196 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ERC2-IT1O76042 136 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 KLRD1Q13241 179 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 LTC4SQ16873 150 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 RTL8BQ17RB0 113 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP1CQ5VVH2 108 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 DYDC1Q8WWB3 177 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ITPR2Q14571 2701 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WSZ3 146 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 GPR31O00270 319 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 FABP1P07148 127 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 DCUN1D2Q6PH85 259 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MED11Q9P086 117 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 LRBAP50851 2863 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 PSME4Q14997 1843 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 PATJQ8NI35 1801 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CENPHQ9H3R5 247 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R7Q9NYW3 318 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HIVEP1P15822 2718 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 ODAMA1E959 279 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 RER1O15258 196 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 CST7O76096 145 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MSMO1Q15800 293 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 RAB37Q96AX2 223 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 HYLS1Q96M11 299 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf24Q9Y442 160 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 MYLKQ15746 1914 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-212ENST00000491302 RYR1P21817 5038 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ACACAQ13085 2346 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T8A6NH00 312 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 B4DSR2 109 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 H3BQV1 296 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CD2P06729 351 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL8P10145 99 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 HBBP68871 147 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00052Q96N35 136 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CUBNO60494 3623 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 MGAQ8IWI9 3026 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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