RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.78□□□□□ -0.2
NELFE-210ENST00000491139 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NELFE-210ENST00000491139 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 LELP1Q5T871 98 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 SCXQ7RTU7 201 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 TMED6Q8WW62 240 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 BCL2L11O43521 198 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 GNRH2O43555 120 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 RANP62826 216 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 LECT2O14960 151 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 CXorf1O96002 111 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 GCHFRP30047 84 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 DIRC3C9JPN6 131 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 RHOHQ15669 191 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 LINC01620Q4KN68 170 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 SEC11BP0C7V7 166 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 ZNF726P1Q15940 193 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 STOML3Q8TAV4 291 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 CIDEAO60543 219 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-210ENST00000491139 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRE2 83 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 PGPA6NDG6 321 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 UMAD1C9J7I0 102 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TYMSP04818 313 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.7□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 ZNF876PQ49A33 203 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TOR2AQ5JU69 321 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 Q8N3U1 123 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 BAALCQ8WXS3 180 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 KCNS1Q96KK3 526 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.69□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 GGTLC3B5MD39 225 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 HYLS1Q96M11 299 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 COX11Q9Y6N1 276 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.68□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 RS1O15537 224 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 PFDN1O60925 122 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TMUB2Q71RG4 321 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 AKAP14Q86UN6 197 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.67□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TCRAP04437 139 aa13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 Q8N976 141 aa13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 F6UZH7 168 aa13.65□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.65□□□□□ -0.22
NELFE-210ENST00000491139 K7EQM0 130 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 GNG5P63218 68 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 RMI2Q96E14 147 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 TREM1Q9NP99 234 aa13.64□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 IGLV2-8P01709 118 aa13.63□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.63□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 EPDR1Q9UM22 224 aa13.63□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 FAM74A7A6NL05 159 aa13.62□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 FHITP49789 147 aa13.62□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 TVP23CQ96ET8 276 aa13.62□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.62□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.61□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 IGLV2-11P01706 119 aa13.61□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 RAB5CP51148 216 aa13.61□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NELFE-210ENST00000491139 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms