RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 WASHC3Q9Y3C0 194 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0B4J2C4 111 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLC7A0M8Q6 106 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5H14A6NHG9 310 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 K7EIM0 57 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 COX7A2P2O60397 106 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 GGCTO75223 188 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 P0DMU3 169 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM231AP0DMU4 169 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM231CP0DMU5 169 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PTHLHP12272 177 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 GZMHP20718 246 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 RCVRNP35243 200 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 HTR2BP41595 481 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FXYD7P58549 80 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFA1P59665 94 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFA3P59666 94 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB131AP59861 70 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS25P62851 125 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 WT1-ASQ06250 92 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF846Q147U1 533 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LPCAT3Q6P1A2 487 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZSA8 131 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 C6orf201Q7Z4U5 140 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP82Q8N141 532 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF565Q8N9K5 539 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8A1Q8NGG7 326 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MCFD2Q8NI22 146 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DCANP1Q8TF63 244 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MAFIPQ8WZ33 124 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TSC22D3Q99576 134 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRT1Q99946 306 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FAAP24Q9BTP7 215 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51E2Q9H255 320 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 SMPXQ9UHP9 88 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 JPT1Q9UK76 154 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 V9GYH0 126 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WTM6 91 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP12A6NFH5 140 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2T8A6NH00 312 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM223BA6NKX1 122 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MCRIP1C9JLW8 97 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TGOLN2O43493 480 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD6O75340 191 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA10P01566 189 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-53P01767 116 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA4P05014 189 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSGP08311 255 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A6P12236 298 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MIFP14174 115 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 M6PRP20645 277 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMB6P28072 239 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 S100GP29377 79 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2KP61086 200 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 VBP1P61758 197 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NCS1P62166 190 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRB3P79483 266 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SPCS2Q15005 226 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RSU1Q15404 277 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TNXAQ16473 311 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ESRGQ1W209 222 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM223AQ8IWN6 122 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM229BQ8NBD8 167 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4A5Q8NH83 315 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM203Q969S6 136 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FMC1Q96HJ9 113 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DIRAS2Q96HU8 199 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 USMG5Q96IX5 58 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 YPEL4Q96NS1 127 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GPER1Q99527 375 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LPAR5Q9H1C0 372 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A6AQ9H2W1 248 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AK3Q9UIJ7 227 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 KMT2DO14686 5537 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms