RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 M0R036 132 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CIDEAO60543 219 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GYPEP15421 78 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 K7EQD1 137 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RTL8CO15255 209 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IFNA1P01562 189 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTH2Q96A98 100 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRIP1P50238 77 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCL20P78556 96 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BAGE2Q86Y30 109 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SYT8Q8NBV8 401 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IL36BQ9NZH7 164 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H3BVH4 76 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RS1O15537 224 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A8MWV9 139 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NXPH4O95158 308 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C6orf223Q8N319 242 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SIVA1O15304 175 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC01559Q495D7 138 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1W2PPQ1 181 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RHOHQ15669 191 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNLZQ5SXM8 178 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDE6DO43924 150 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRR27Q6MZM9 219 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C11orf52Q96A22 123 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BCL2P10415 239 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MLST8Q9BVC4 326 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PARLQ9H300 379 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 M0R381 172 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RHODO00212 210 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFP82Q8N141 532 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DERL1Q9BUN8 251 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VAX2Q9UIW0 290 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GNG4P50150 75 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BLOC1S1P78537 153 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CENPWQ5EE01 88 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MED9Q9NWA0 146 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GVG6 124 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MED14OSP0DP75 135 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 JPT2Q9H910 190 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GVY2 172 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CXCL1P09341 107 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EVI2AP22794 236 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM12Q96EX1 92 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TIRAPP58753 221 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SFRP2Q96HF1 295 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BIN3Q9NQY0 253 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PKHD1P08F94 4074 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A087WWL8 130 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAB19A4D1S5 217 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 K7EP13 123 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNP2Q05952 138 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE12JA6NER3 117 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00315P59091 139 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms