RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM86BQ8N661 226 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIGXQ8TBF5 258 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35B4Q969S0 331 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf50Q96LR7 162 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51I1Q9H343 314 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52A1Q9UKL2 312 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 LY96Q9Y6Y9 160 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCN7AQ01118 1682 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-1.05□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TECPR2O15040 1411 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPDO75976 1380 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3P01024 1663 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV27A0A087WT01 109 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A096LNT2 108 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 C17orf112F2Z3M2 114 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV1-51P01701 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBP1P09455 135 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PATE2Q6UY27 113 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q96NJ1 140 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRIPTQ9P021 101 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 WNK3Q9BYP7 1800 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 A2MP01023 1474 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-1.06□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQGAP1P46940 1657 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WTM6 91 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP12A6NFH5 140 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 J3QRK9 145 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV3-30P01768 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINB9P50453 376 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSME3P61289 254 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK6Q00534 326 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 C22orf39Q6P5X5 142 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARPINQ7Z6K5 226 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 UQCC1Q9NVA1 299 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 MROH2AA6NES4 1674 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTPRGP23470 1445 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.07□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK2Q92608 1830 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8KD6RF30 607 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIRO00625 290 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOEP02649 317 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFITM1P13164 125 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ETV6P41212 452 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 VBP1P61758 197 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST3H3Q16695 136 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4S1Q8NGB4 309 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB8BQ92930 207 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TREM1Q9NP99 234 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-1.08□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLPSL1A2RUU4 121 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM114B3SHH9 223 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 FXYD1O00168 92 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ISG15P05161 165 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX5BP10606 129 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 EVI2AP22794 236 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX6A2Q02221 97 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFF3Q07654 80 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASC2Q6XLA1 102 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPTC7Q8NI37 304 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB37Q96AX2 223 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO5Q9UKT4 447 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 RICTORQ6R327 1708 aa-1.09□□□□□ -2.58
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms