RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB125Q8N687 156 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 M0R143 59 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PRO1933Q9H354 126 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 H3BMM0 161 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 OR11H2Q8NH07 326 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 F8P00451 2351 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 GAGE12JA6NER3 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 GAGE1Q13065 139 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 GAGE4Q13068 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 GAGE5Q13069 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 Q1RN00 199 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 GAGE13Q4V321 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N2B8 174 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 ESM1Q9NQ30 184 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2CO00762 179 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS2P07478 247 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 FSHBP01225 129 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PKIAP61925 76 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 RHOHQ15669 191 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB135Q30KP9 77 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N1Y9 231 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 MED14OSP0DP75 135 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TCTAP57738 103 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PET117Q6UWS5 81 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 I3L3M4 83 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PAX4O43316 350 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA45Q537H7 98 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 SEC11AP67812 179 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 Q0VG73 95 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5G1P05496 136 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 PROK1P58294 105 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 COPS9Q8WXC6 57 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 F8W735 103 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 MALP21145 153 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N8P6 123 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 C20orf173Q96LM9 149 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 C20orf78Q9BR46 151 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 REV3LO60673 3130 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 A0A096LNT2 108 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 DPM2O94777 84 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 ATOH7Q8N100 152 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CIDEAO60543 219 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP161Q6P656 301 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 LAMA1P25391 3075 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SORL1Q92673 2214 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 DCANP1Q8TF63 244 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 MLST8Q9BVC4 326 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CTRLP40313 264 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM243Q9BU79 118 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 CENPEQ02224 2701 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 A6NJY4 79 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SPRY2O43597 315 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 NPYP01303 97 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf52A6NGY3 159 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 GTSF1Q8WW33 167 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 A6NDN8 102 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV1-51P01701 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV2-8P01709 118 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-211ENST00000486161 IGKCP01834 107 aa6.18□□□□□ -1.42
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