RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 KNTC1P50748 2209 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 IGIPA6NJ69 53 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 F8W735 103 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 SMKR1H3BMG3 65 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 LGALS9O00182 355 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 CDIP1Q9H305 208 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.4□□□□□ -1.38
C1orf43-208ENST00000483282 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.4□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 K7ERJ3 54 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CNTFRP26992 372 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CXCL5P42830 114 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 UCNP55089 124 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TM4SF20Q53R12 229 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 PRORYQ9H606 182 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CEP250Q9BV73 2442 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 H3BMM0 161 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 I3L3M4 83 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 IGF1P05019 195 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF415Q09FC8 603 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 Q1RN00 199 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 Q8TAT8 98 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 RASL10AQ92737 203 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 UBE2WQ96B02 151 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CACNA1BQ00975 2339 aa6.38□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 H3BVH4 76 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 IGHV3-33P01772 117 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 LINC01620Q4KN68 170 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 Q8N9W7 124 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 KLLNB2CW77 178 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 KLK10O43240 276 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TCL1BO95988 128 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 APELAP0DMC3 54 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 AMTNQ6UX39 209 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM223A0PJW6 202 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 C9JAW5 83 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 EFNA4P52798 201 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 HERV-K104P63124 156 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CFAP161Q6P656 301 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 C2orf82Q6UX34 121 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00643Q86TS7 51 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 GPHB5Q86YW7 130 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MED13Q9UHV7 2174 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 F5H697 171 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 MGPP08493 103 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 GATA3P23771 443 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 XGP55808 180 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 FOXC1Q12948 553 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF575Q86XF7 245 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
C1orf43-208ENST00000483282 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.34□□□□□ -1.39
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