RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 TYMSP04818 313 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 CRIP1P50238 77 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 BAGE2Q86Y30 109 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 C6orf223Q8N319 242 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 C11orf52Q96A22 123 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF479Q96JC4 524 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 PDE6DO43924 150 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 SFTA3P0C7M3 94 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 TEX261Q6UWH6 196 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 NHLRC2Q8NBF2 726 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 SLAQ13239 276 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 MED9Q9NWA0 146 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 TNP2Q05952 138 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 DERL1Q9BUN8 251 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 RBFOX3A6NFN3 312 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 M0R2P5 195 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 FAM162BQ5T6X4 162 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 SH2D1AO60880 128 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 ORM1P02763 201 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF674Q2M3X9 581 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 TTC32Q5I0X7 151 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 MLST8Q9BVC4 326 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1W2PPQ1 181 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 RAB19A4D1S5 217 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 LRP1BQ9NZR2 4599 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 B4DEV8 164 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 M0R036 132 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 K7EQD1 137 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 GNG4P50150 75 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 C9orf85Q96MD7 179 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 RYR1P21817 5038 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRD-210ENST00000481079 NXPH4O95158 308 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 ASIPP42127 132 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 TOR2AQ5JU69 321 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 PRR27Q6MZM9 219 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF575Q86XF7 245 aa16.39■□□□□ 0.21
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PTPRD-210ENST00000481079 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 GYPEP15421 78 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 LINC01559Q495D7 138 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 FAM210AQ96ND0 272 aa16.38■□□□□ 0.21
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PTPRD-210ENST00000481079 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 C9JCJ5 164 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM250H0YL14 139 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV2-8P01709 118 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 MED14OSP0DP75 135 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 MGST1P10620 155 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 BTF3P20290 206 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 SRIP30626 198 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF876PQ49A33 203 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 PTH2Q96A98 100 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 DNLZQ5SXM8 178 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM12Q96EX1 92 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 RS1O15537 224 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 CEBPGP53567 150 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 PARLQ9H300 379 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 IL36BQ9NZH7 164 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-210ENST00000481079 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00315P59091 139 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 H3BVH4 76 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 HSPG2P98160 4391 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 BIN3Q9NQY0 253 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 SRP19P09132 144 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 OCC1Q8TAD7 63 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 WFDC10BQ8IUB3 73 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 CIDEAO60543 219 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 RAB14P61106 215 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 APOBP04114 4563 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-210ENST00000481079 PCLOQ9Y6V0 5065 aa16.28■□□□□ 0.2
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