RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	C11orf52	Q96A22	123 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.65	□□□□□ -1.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RS1	O15537	224 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ORM1	P02763	201 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GYPE	P15421	78 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASIP	P42127	132 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB5C	P51148	216 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	JPT2	Q9H910	190 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		7.64	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.63	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PARL	Q9H300	379 aa		7.63	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCL2	P10415	239 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZSN1	163 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9H8V8	135 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL36B	Q9NZH7	164 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	NXPH4	O95158	308 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRI	P30626	198 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	BAGE2	Q86Y30	109 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTH2	Q96A98	100 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLA	Q13239	276 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9UF83	564 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0R381	172 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNP2	Q05952	138 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	C6orf223	Q8N319	242 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKD1	P98161	4303 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WWL8	130 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIVA1	O15304	175 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNA1	P01562	189 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHOH	Q15669	191 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959		A8MWV9	139 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GZMB	P10144	247 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00315	P59091	139 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC32	Q5I0X7	151 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNAI2	O43623	268 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE6D	O43924	150 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRYGD	P07320	174 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CXCL1	P09341	107 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED14OS	P0DP75	135 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNG4	P50150	75 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFRP2	Q96HF1	295 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKHD1	P08F94	4074 aa		7.55	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms