RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	NPY	P01303	97 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	PMCHL1	Q16048	86 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	AGRN	O00468	2067 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230		A8MTW9	85 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRY2	O43597	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	PF4	P02776	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	LEPROTL1	O95214	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	TNFRSF6B	O95407	300 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	CUBN	O60494	3623 aa		13.52	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N1Y9	231 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	STH	Q8IWL8	128 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	NF1	P21359	2839 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	CBY3	A6NI87	242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	TSTD3	H0UI37	97 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	NXPH4	O95158	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	MGP	P08493	103 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	PKIA	P61925	76 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	SORL1	Q92673	2214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	GAS8-AS1	O95177	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	HTN1	P15515	57 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	INS	P01308	110 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	NRAC	Q8N912	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N976	141 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC4	Q99102	2169 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N8P6	123 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	VAMP8	Q9BV40	100 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	HBD	P02042	147 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01587	Q99440	93 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf202	A1L168	122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	PRSS47	A8MTI9	375 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	PPP1R17	O96001	155 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	JPT2	Q9H910	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF415	Q09FC8	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WWL8	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01546	A6NGU7	62 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230		F5H697	171 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	RASL10A	Q92737	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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