RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 TMEM141Q96I45 108 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 IGHV4-59P01825 116 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 RBX1P62877 108 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 SPXQ9BT56 116 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 ZNF747Q9BV97 191 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 K7EMI3 77 aa6.01□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 IGKV3-20P01619 116 aa6.01□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.01□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 NCR2O95944 276 aa6□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 SCRT2Q9NQ03 307 aa6□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 APOC4P55056 127 aa5.98□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 Q8N6K4 173 aa5.97□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 C1orf159Q96HA4 380 aa5.97□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 E7EUB6 86 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 I3L2K1 104 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 AMTNQ6UX39 209 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SPEGQ15772 3267 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CCL24O00175 119 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CFC1BP0CG36 223 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CFC1P0CG37 223 aa5.96□□□□□ -1.46
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