RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCGP01275 180 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCRAP04437 139 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNG5P63218 68 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SMUG1Q53HV7 270 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGTLC3B5MD39 225 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UPK1BO75841 260 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGLV2-11P01706 119 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STAG3L2P0CL84 134 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STAG3L3P0CL85 134 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAB2AP61019 212 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZFP69Q49AA0 526 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC00479Q96M42 142 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PARLQ9H300 379 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WFDC1Q9HC57 220 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSG8Q9UQ74 426 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RNF222A6NCQ9 220 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SEC11BP0C7V7 166 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q8N3U1 123 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q8N976 141 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RMI2Q96E14 147 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SGK494Q96LW2 274 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EPDR1Q9UM22 224 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LECT2O14960 151 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCHFRP30047 84 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCXQ7RTU7 201 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL36BQ9NZH7 164 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE12JA6NER3 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RHODO00212 210 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SSNA1O43805 119 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OXTP01178 125 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MBP02144 154 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SERF2P84101 59 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFITM3Q01628 133 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE1Q13065 139 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE4Q13068 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE5Q13069 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE13Q4V321 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DNLZQ5SXM8 178 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NIT1Q86X76 327 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SYT8Q8NBV8 401 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BAALCQ8WXS3 180 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAB24Q969Q5 203 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A1W2PRE2 83 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRNTQ86SH4 94 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q9UF83 564 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXorf1O96002 111 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGLV2-8P01709 118 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ASIPP42127 132 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ELOBQ15370 118 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC01620Q4KN68 170 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP6V0CP27449 155 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q0VG73 95 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 JPT2Q9H910 190 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KLK12Q9UKR0 248 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A087WX48 190 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 B4DEV8 164 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms