RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426722.5

NELFE-203, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-203ENST00000426722 DEFA1P59665 94 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 DEFA3P59666 94 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 IFITM3Q01628 133 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 SGK494Q96LW2 274 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 COX11Q9Y6N1 276 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 SERF2P84101 59 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 EPDR1Q9UM22 224 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 A0A087WWC5 75 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 J3QL48 77 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 SEC11BP0C7V7 166 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 GCHFRP30047 84 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 HAMPP81172 84 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 RAB24Q969Q5 203 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 PARLQ9H300 379 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 GGTLC3B5MD39 225 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 CXorf1O96002 111 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 IGLV2-11P01706 119 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 LINC00694P0DN24 101 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 Q6ZSA8 131 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 PRNTQ86SH4 94 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 RMI2Q96E14 147 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 A0A1W2PRE2 83 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-203ENST00000426722 MYCBP2O75592 4640 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 GAGE12JA6NER3 117 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ATP6V0CP27449 155 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ASIPP42127 132 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 GAGE1Q13065 139 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 GAGE4Q13068 117 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 GAGE5Q13069 117 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 GAGE13Q4V321 117 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 LINC00479Q96M42 142 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 IL36BQ9NZH7 164 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 RHODO00212 210 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 WFDC2Q14508 124 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 DNLZQ5SXM8 178 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 Q8N976 141 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 AQP10Q96PS8 301 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ELOBQ15370 118 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 SYT8Q8NBV8 401 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 RNF222A6NCQ9 220 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 B4DEV8 164 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 NIT1Q86X76 327 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 Q8N3U1 123 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 BAALCQ8WXS3 180 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 A6NHS1 94 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 LECT2O14960 151 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 IFNA7P01567 189 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 JPT2Q9H910 190 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 ALG5Q9Y673 324 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-203ENST00000426722 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.46□□□□□ -1.06
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