RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 FOXC2Q99958 501 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 CR1P17927 2039 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 AVPP01185 164 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 NMUP48645 174 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 TAL2Q16559 108 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 TOMM6Q96B49 74 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 A0A087WW49 117 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 C9orf118A6NHY6 69 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 H7C1H1 209 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 CBY3A6NI87 242 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 LGALS9O00182 355 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 DCANP1Q8TF63 244 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 F8VRH5 84 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 ELANEP08246 267 aa9.8□□□□□ -0.84
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PRAME-203ENST00000402697 Q6ZVH6 145 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 RASL10AQ92737 203 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 PCP2Q8IVA1 136 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 RNF152Q8N8N0 203 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 CREBBPQ92793 2442 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 LINC01619G3V211 115 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-203ENST00000402697 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZQT7 251 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZS46 218 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 TMEM160Q9NX00 188 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 ERASQ7Z444 233 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 TM2D2Q9BX73 214 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 GAGE10A6NGK3 116 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 PLA2G2AP14555 144 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 F6UB75 175 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 J3KRW8 73 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 K7EQG2 157 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 GNRH2O43555 120 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 FSHBP01225 129 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 IGHV4-59P01825 116 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 SMIM13P0DJ93 91 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 A0A0J9YX75 114 aa9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 MGPP08493 103 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 LINC00315P59091 139 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 Q6YL49 198 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 TMEM141Q96I45 108 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 C9orf85Q96MD7 179 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 Q5PR19 223 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 KIR2DL4Q99706 377 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 CSTL1Q9H114 145 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 K7EP34 96 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-203ENST00000402697 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 OR11H12B2RN74 326 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 TGFAP01135 160 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-203ENST00000402697 CD7P09564 240 aa9.73□□□□□ -0.85
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