RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 SAP30O75446 220 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 ACACBO00763 2458 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 GATD1Q8NB37 220 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAC2D3DTV9 90 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A20O43772 301 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.72□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.71□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V0BQ99437 205 aa12.71□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.71□□□□□ -0.37
CTDSP2-201ENST00000398073 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.71□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.71□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 PLXNB1O43157 2135 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ODF1Q14990 250 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 HTN3P15516 51 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8N7P7 452 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.7□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 HCFC1P51610 2035 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRY2O43597 315 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 XCL2Q9UBD3 114 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC6Q6W4X9 2439 aa12.69□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 CFC1BP0CG36 223 aa12.68□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 CFC1P0CG37 223 aa12.68□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.68□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.67□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01619G3V211 115 aa12.67□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ELANEP08246 267 aa12.67□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.67□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.66□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.66□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 NBL1P41271 181 aa12.66□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 LRP4O75096 1905 aa12.66□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 MYCNOSP40205 109 aa12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE12JA6NER3 117 aa12.65□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE4Q13068 117 aa12.65□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE5Q13069 117 aa12.65□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.65□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 JPT2Q9H910 190 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PLD3 99 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 J3QLI3 93 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 MED14OSP0DP75 135 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 WFDC2Q14508 124 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF223E7ERA6 249 aa12.63□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 TOMM6Q96B49 74 aa12.63□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 HERVK_113P63121 156 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRSQ13332 1948 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLC6P0CF74 106 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 AJUBAQ96IF1 538 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 EML5Q05BV3 1969 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 CARD19Q96LW7 228 aa12.62□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYGBP07316 175 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 SS18Q15532 418 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 VWC2LB2RUY7 222 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 BAALCQ8WXS3 180 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM243Q9BU79 118 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF114Q9Y508 228 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.61□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM17AQ99595 171 aa12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 G3V4G9 280 aa12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.6□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.59□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 TEN1Q86WV5 123 aa12.59□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 IFITM1P13164 125 aa12.59□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 BLCAPP62952 87 aa12.59□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.58□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0J9YXV3 536 aa12.58□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 A4D1N5 150 aa12.58□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 SIRPDQ9H106 197 aa12.58□□□□□ -0.39
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS47A8MTI9 375 aa12.58□□□□□ -0.4
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB130BP0DP73 79 aa12.58□□□□□ -0.4
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB130AP0DP74 79 aa12.58□□□□□ -0.4
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00310P59036 64 aa12.58□□□□□ -0.4
CTDSP2-201ENST00000398073 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms