RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.6□□□□□ -1.03
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TRAPPC3-201ENST00000373159 Q8N976 141 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 BAALCQ8WXS3 180 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.6□□□□□ -1.03
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A087WWC5 75 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF222A6NCQ9 220 aa8.59□□□□□ -1.03
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TRAPPC3-201ENST00000373159 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.59□□□□□ -1.03
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TRAPPC3-201ENST00000373159 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.59□□□□□ -1.03
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TRAPPC3-201ENST00000373159 A8MWV9 139 aa8.58□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 GAGE5Q13069 117 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC01620Q4KN68 170 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAGE13Q4V321 117 aa8.58□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.58□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 RMI2Q96E14 147 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 SEC11BP0C7V7 166 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG3L2P0CL84 134 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG3L3P0CL85 134 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.57□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00479Q96M42 142 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q9UF83 564 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 EPDR1Q9UM22 224 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.56□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 S100ZQ8WXG8 99 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.56□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRNTQ86SH4 94 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 NIT1Q86X76 327 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.55□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 RAB24Q969Q5 203 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 JPT2Q9H910 190 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL36BQ9NZH7 164 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 SSNA1O43805 119 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV2-8P01709 118 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASIPP42127 132 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.53□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 KLK12Q9UKR0 248 aa8.53□□□□□ -1.04
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TRAPPC3-201ENST00000373159 DNLZQ5SXM8 178 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2WQ96B02 151 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A087WX48 190 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 CXorf1O96002 111 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 MBP02144 154 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERF2P84101 59 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PRE2 83 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q0VG73 95 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 C14orf177Q52M58 125 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.5□□□□□ -1.05
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