RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 RNF152Q8N8N0 203 aa8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 CFHR4Q92496 578 aa8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 MSMPQ1L6U9 139 aa8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.02□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 H3BMM0 161 aa8.02□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 DLEU1O43261 78 aa8.02□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.02□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2WQ96B02 151 aa8.02□□□□□ -1.12
ZNF548-202ENST00000366197 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 J3QQQ9 107 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV2-23P01705 113 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGHG2P01859 326 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 K7EMI3 77 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 K7EMT4 169 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 DSCAMO60469 2012 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ATP5G1P05496 136 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 A0A087WW49 117 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 PATE2Q6UY27 113 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 CRYGCP07315 174 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 K7EN84 100 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 XCL1P47992 114 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf70A6NJV1 201 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 MYCNOSP40205 109 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2V1Q13404 147 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 GPHB5Q86YW7 130 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 NCKAP5O14513 1909 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 PCDH15Q96QU1 1955 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SPRY2O43597 315 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGLC2P0DOY2 106 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGLC3P0DOY3 106 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF843Q8N446 348 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SIRPDQ9H106 197 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 Q9HAA7 133 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM89A2RUT3 159 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 INAFM2P0DMQ5 153 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZWC4 215 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 LTBP2Q14767 1821 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGLL1P15814 213 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf74Q96GX8 76 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SCRT2Q9NQ03 307 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SOCS3O14543 225 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 CCL18P55774 89 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 COX8AP10176 69 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TEX22C9J3V5 150 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 GYPEP15421 78 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZQT7 251 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 LRRK2Q5S007 2527 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SPINK8P0C7L1 97 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 MORN5Q5VZ52 161 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 LMO4P61968 165 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 MED12LQ86YW9 2145 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 FGF6P10767 208 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TAL2Q16559 108 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 C5orf38Q86SI9 138 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF747Q9BV97 191 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2BP63146 152 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 DKK2Q9UBU2 259 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 COX11Q9Y6N1 276 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-202ENST00000366197 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms