RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 RASL10AQ92737 203 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 PRSS47A8MTI9 375 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 NXPH4O95158 308 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 PET117Q6UWS5 81 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 DEFB125Q8N687 156 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TSPOP30536 169 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 OR11H1Q8NG94 326 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 HBDP02042 147 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 M0R143 59 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 CD5LO43866 347 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 PPBPP02775 128 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 PRM2P04554 102 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 J3QKU1 62 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TCAPO15273 167 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C4orf3Q8WVX3 66 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MDFICQ9P1T7 246 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 CACNG7P62955 275 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 SPINK13Q1W4C9 94 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 Q6ZN92 141 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 POM121L12Q8N7R1 296 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C18orf15Q96N68 181 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 SMR3AQ99954 134 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ASIPP42127 132 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 STPG4Q8N801 248 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 DKK2Q9UBU2 259 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 HIVEP1P15822 2718 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ID1P41134 155 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LEPP41159 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 Q8N8P6 123 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C7orf71A4D174 169 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MED14OSP0DP75 135 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 KNCNA6PVL3 124 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LINC01619G3V211 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 FGF6P10767 208 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 Q8N1Y9 231 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 RAX2Q96IS3 184 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C9orf85Q96MD7 179 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ODF3Q96PU9 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 FCER1GP30273 86 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM86BQ8N661 226 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C20orf202A1L168 122 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 A8MTW9 85 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 CD28P10747 220 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 TCTAP57738 103 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ST20Q9HBF5 79 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ANK2Q01484 3957 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 CD7P09564 240 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 Q6ZVH6 145 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 FHL3Q13643 280 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ODF1Q14990 250 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 MRAP2Q96G30 205 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 ZMAT4Q9H898 229 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC25-201ENST00000356537 CDKN1BP46527 198 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 BATFQ16520 125 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 DPF1Q92782 380 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 A0A087WWL8 130 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC25-201ENST00000356537 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms