RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346279.3

XAGE3-201, Transcript of X antigen family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XAGE3, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAGE3-201ENST00000346279 CSN1S1P47710 185 aa4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 RASL10AQ92737 203 aa4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.59□□□□□ -1.67
XAGE3-201ENST00000346279 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 F6UZH7 168 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 F8W036 122 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 H3BNG1 76 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CXorf1O96002 111 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 IGHV3-53P01767 116 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 MBP02144 154 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 SFTA3P0C7M3 94 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CRIP1P50238 77 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 COMMD7Q86VX2 200 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF479Q96JC4 524 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 EPDR1Q9UM22 224 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PSG8Q9UQ74 426 aa4.58□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 A0A1W2PRE2 83 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 FAM74A7A6NL05 159 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 HMSDA8MTL9 139 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TAAR5O14804 337 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TYMSP04818 313 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CRYBA4P53673 196 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CLLU1Q5K131 121 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 C12orf57Q99622 126 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 Q9H8V8 135 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TREM1Q9NP99 234 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 BIN3Q9NQY0 253 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.57□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 AKR1D1P51857 326 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 UBE2G2P60604 165 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 RAB4BP61018 213 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PRNTQ86SH4 94 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 UPK3BQ9BT76 320 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 RYR1P21817 5038 aa4.56□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 GCGP01275 180 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 S100A8P05109 93 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 SMIM6P0DI80 62 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 S100PP25815 95 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CCL18P55774 89 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CCL20P78556 96 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF415Q09FC8 603 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF345Q14585 488 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 C9orf85Q96MD7 179 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ATG101Q9BSB4 218 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 SPXQ9BT56 116 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 MED9Q9NWA0 146 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 Q9UF83 564 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PRO0255Q9UI72 69 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 NAGKQ9UJ70 344 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 HSPG2P98160 4391 aa4.55□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.54□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.54□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.54□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 K7EQD1 137 aa4.54□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 M0R2P5 195 aa4.54□□□□□ -1.68
XAGE3-201ENST00000346279 PEX7O00628 323 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms