RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 MED14OSP0DP75 135 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.24□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.24□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 H3BMM0 161 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 PPBPP02775 128 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 CD7P09564 240 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DRB4P13762 266 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-3P60369 221 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 PKIAP61925 76 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TCF21O43680 179 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TDRG1Q3Y452 100 aa13.23□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 OR4C46A6NHA9 309 aa13.22□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF6BO95407 300 aa13.22□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.21□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.21□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 A8MTW9 85 aa13.21□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 LEPROTL1O95214 131 aa13.21□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.2□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.2□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 MAP1LC3AQ9H492 121 aa13.2□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 FOSL1P15407 271 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 Q8N1Y9 231 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 MDFICQ9P1T7 246 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 TSTD3H0UI37 97 aa13.19□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 A0A096LNJ9 63 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 SAP30O75446 220 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 NXPH4O95158 308 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 NRACQ8N912 160 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.18□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 C9orf85Q96MD7 179 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 HIVEP1P15822 2718 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 JPT2Q9H910 190 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 MGPP08493 103 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 MRAP2Q96G30 205 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 ATOH7Q8N100 152 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 AP1S3Q96PC3 154 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 CRLF1O75462 422 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 DDTP30046 118 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 VAMP8Q9BV40 100 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 LINC01546A6NGU7 62 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 CBY3A6NI87 242 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRM2P04554 102 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 HTN1P15515 57 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 Q8N8P6 123 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 ZNF747Q9BV97 191 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRSS47A8MTI9 375 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR11H12B2RN74 326 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 LINC00315P59091 139 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL5AQ8N109 375 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 RASL10AQ92737 203 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WWL8 130 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 H0Y8G0 127 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 IGLV1-51P01701 117 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 HBDP02042 147 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 SMIM17P0DL12 118 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAJINQ3KP22 176 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 STHQ8IWL8 128 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 DEFB125Q8N687 156 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 SPATA45Q537H7 98 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 PET117Q6UWS5 81 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 SYT8Q8NBV8 401 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms