RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 A8MWV9 139 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TCL1BO95988 128 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 GLMPQ8WWB7 406 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 LINC01600Q96MT4 127 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 H3BVH4 76 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-30P01768 117 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CRYGDP07320 174 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 LYNX1P0DP58 116 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C15orf32Q32M92 178 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 HERVK_113P61574 105 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 PTH2Q96A98 100 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CITED1Q99966 193 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CLEC3BP05452 202 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CD3EP07766 207 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CFC1BP0CG36 223 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CFC1P0CG37 223 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 SRD5A1P18405 259 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ASIPP42127 132 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 KLK15Q9H2R5 256 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 SPTA1P02549 2419 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TACC2O95359 2948 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WW49 117 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ZNF843Q8N446 348 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 DEFB124Q8NES8 71 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 RNF183Q96D59 192 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGIPA6NJ69 53 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C11orf86A6NJI1 115 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 NXPH4O95158 308 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TSHBP01222 138 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 PRR9Q5T870 116 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZQT7 251 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 GPHB5Q86YW7 130 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 Q8N9W7 124 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TMEM141Q96I45 108 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 LINC00477Q96M19 166 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 CCDC140Q96MF4 163 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 METTL26Q96S19 204 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 PMVKQ15126 192 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 AMELXQ99217 191 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 LINC01548A6NM66 108 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 GAGE5Q13069 117 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 GAGE6Q13070 117 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TEX29Q8N6K0 151 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TIMM17AQ99595 171 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 P0DMU3 169 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 FAM231AP0DMU4 169 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 FAM231CP0DMU5 169 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-202ENST00000328514 PTPN13Q12923 2485 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 RHODO00212 210 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 AJUBAQ96IF1 538 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 OVOL1O14753 267 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A20O43772 301 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 LINC00315P59091 139 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 Q6Q795 121 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SFTA2Q6UW10 78 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZS46 218 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TIMD4Q96H15 378 aa8.51□□□□□ -1.05
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