RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1A2P50226 295 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB5CP51148 216 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL20P78556 96 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4DEV8 164 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORM1P02763 201 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRIP30626 198 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC51BQ86UW2 128 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf223Q8N319 242 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R036 132 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC32Q5I0X7 151 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MANBALQ9NQG1 85 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL36BQ9NZH7 164 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERC2O95714 4834 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BVH4 76 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXPH4O95158 308 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01559Q495D7 138 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNLZQ5SXM8 178 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG13Q9P2W3 67 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPQ1 181 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF575Q86XF7 245 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIVA1O15304 175 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIDEAO60543 219 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf52Q96A22 123 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLST8Q9BVC4 326 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARLQ9H300 379 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX46H3BTG2 121 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNP2Q05952 138 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOHQ15669 191 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAGE2Q86Y30 109 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DERL1Q9BUN8 251 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MWV9 139 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPT2Q9H910 190 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GVG6 124 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZSN1 163 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT8Q8NBV8 401 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2P10415 239 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIRAPP58753 221 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00315P59091 139 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA1P01562 189 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED14OSP0DP75 135 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPWQ5EE01 88 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR27Q6MZM9 219 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R381 172 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCL1P09341 107 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV2-8P01709 118 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00694P0DN24 101 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP82Q8N141 532 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFRP2Q96HF1 295 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB19A4D1S5 217 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHODO00212 210 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE6DO43924 150 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WWL8 130 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q9UF83 564 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAX2Q9UIW0 290 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms