RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.36□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.36□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.35□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF56Q15929 161 aa11.35□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.35□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRY4Q9C004 299 aa11.35□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.35□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf86A6NJI1 115 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGF1P05019 195 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAALCQ8WXS3 180 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.34□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 A4D1N5 150 aa11.33□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WWL8 130 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIFOQ8TCI5 191 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 AKAP13Q12802 2813 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 C15orf32Q32M92 178 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00311Q8N616 119 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASL10AQ92737 203 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIMD4Q96H15 378 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFC1BP0CG36 223 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFC1P0CG37 223 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 NRACQ8N912 160 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB124Q8NES8 71 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACACBO00763 2458 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01559Q495D7 138 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 VCX2Q9H322 139 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 HTN1P15515 57 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 C2orf82Q6UX34 121 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 DPM3Q9P2X0 92 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0U1RRA0 63 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV3-20P01619 116 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRD5A1P18405 259 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N1Y9 231 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 DUX3Q96PT4 197 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNRH2O43555 120 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTSGP08311 255 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRYGBP07316 175 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0J9YY99 117 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 F6UB75 175 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 CITED1Q99966 193 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV1-47P01700 117 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASIPP42127 132 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 JPT2Q9H910 190 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 J3QQQ9 107 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2D1P51668 147 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXC1Q12948 553 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 METTL26Q96S19 204 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPXQ9BT56 116 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHG4P01861 327 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 G3V318 75 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 TOMM6Q96B49 74 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHODO00212 210 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD7P09564 240 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2D3P61077 147 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2D2P62837 147 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BMM0 161 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD59P13987 128 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2WQ96B02 151 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RS1O15537 224 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATXN8Q156A1 80 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBAKDNA6NC62 111 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01620Q4KN68 170 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms