RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 TMEM75Q8N9X5 138 aa7□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 LINC01546A6NGU7 62 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 E9PLD3 99 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PAX4O43316 350 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 CECR9P0C854 216 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 CACNG7P62955 275 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 ORMDL3Q8N138 153 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 DPH3Q96FX2 82 aa6.99□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 MGAQ8IWI9 3026 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 Q6ZS92 163 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PRELID3AQ96N28 172 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 DSCAMO60469 2012 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 E7EUB6 86 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 TMEM262E9PQX1 116 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 APOMO95445 188 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PLA2G2AP14555 144 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.98□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 ATMQ13315 3056 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 NMUP48645 174 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PRNTQ86SH4 94 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PCP2Q8IVA1 136 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.97□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 D6R8Y8 96 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 K7EM74 188 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 FOXI1Q12951 378 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 CEND1Q8N111 149 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 LINC00311Q8N616 119 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 CCL17Q92583 94 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.96□□□□□ -1.29
MMP3-201ENST00000299855 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 NDUFS5O43920 106 aa6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 FXYD2P54710 66 aa6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 RRN3P1Q2M238 152 aa6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IMUPQ9GZP8 106 aa6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 ATRXP46100 2492 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGLL5B9A064 214 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 J3QKU1 62 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGLV2-23P01705 113 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 MT-ATP8P03928 68 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 GAFA1Q96PS6 74 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 UQCRQO14949 82 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 FCER1GP30273 86 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 CRIP1P50238 77 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 WFDC2Q14508 124 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGKCP01834 107 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 CKS2P33552 79 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 PLGLAQ15195 96 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 DKK2Q9UBU2 259 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 IGHV3-48P01763 117 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 PDE6HQ13956 83 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 AMN1Q8IY45 258 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 BRK1Q8WUW1 75 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.93□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 KALRNO60229 2985 aa6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 H0Y9J4 135 aa6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 TWIST1Q15672 202 aa6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 PRO0461Q9UI25 63 aa6.92□□□□□ -1.3
MMP3-201ENST00000299855 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.92□□□□□ -1.3
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