RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.45■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.44■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD39Q53RE8 183 aa16.44■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 RITA1Q96K30 269 aa16.44■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 AJUBAQ96IF1 538 aa16.43■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.43■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.43■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGLL5B9A064 214 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 CCL24O00175 119 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LPF7 62 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 GTSF1Q8WW33 167 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.42■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.41■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGCP07315 174 aa16.41■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N9W7 124 aa16.41■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 XCL1P47992 114 aa16.41■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZVH6 145 aa16.41■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-47P01700 117 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV2-23P01705 113 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 FAM208BQ5VWN6 2430 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV2-14P01704 120 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 SPRY2O43597 315 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.4■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 TEX22C9J3V5 150 aa16.39■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 ACYP1P07311 99 aa16.39■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.39■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 HIGD1BQ9P298 99 aa16.39■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.39■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.39■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TDRG1Q3Y452 100 aa16.39■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 J3QKU1 62 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRACP01848 142 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBA4P53673 196 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 ORMDL1Q9P0S3 153 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YXV3 536 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 BLCAPP62952 87 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB136Q30KP8 78 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 MED14OSP0DP75 135 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 CTRLP40313 264 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXCQ9NY87 97 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 K7EMT4 169 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf74Q96GX8 76 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 H0YGX0 51 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 SLURP1P55000 103 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TTC28Q96AY4 2481 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 A4D1N5 150 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf38Q86SI9 138 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 SPRY4Q9C004 299 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YY99 117 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 PRAC2D3DTV9 90 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 K7EQD1 137 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 CITED1Q99966 193 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-201ENST00000284617 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM17AQ99595 171 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 DYSFO75923 2080 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM6Q96B49 74 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD2P54710 66 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 E7EUB6 86 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 E9PLD3 99 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZQT7 251 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N1Y9 231 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N7P7 452 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 P0C879 139 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 GPHB5Q86YW7 130 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 ACACBO00763 2458 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms