RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRRX1-201ENST00000239461 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 Q0VG73 95 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRRX1-201ENST00000239461 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 PSMG4Q5JS54 123 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 AJUBAQ96IF1 538 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H4GQ99525 98 aa8.18□□□□□ -1.1
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PRRX1-201ENST00000239461 DEFB130AP0DP74 79 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 HLA-DMBP28068 263 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 J3KT08 172 aa8.17□□□□□ -1.1
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