RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636042.1

KCNQ2-222, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 2, human

TSL 5

Gene KCNQ2, Length 103 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ2-222	ENST00000636042	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	HSPG2	P98160	4391 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042		A0A1W2PRE2	83 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	CXorf1	O96002	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	CCL18	P55774	89 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	UBE2G2	P60604	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042		Q9UF83	564 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KCNQ2-222	ENST00000636042	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		K7EQD1	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PAX4	O43316	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	GCG	P01275	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	MB	P02144	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ZNF345	Q14585	488 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		Q6ZSN1	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		Q86TA4	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SPX	Q9BT56	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		M0R2P5	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PEX7	O00628	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TAAR5	O14804	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	NXPH4	O95158	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	JPT2	Q9H910	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	RS1	O15537	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	GYPE	P15421	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	LINC00315	P59091	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	CCL20	P78556	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		C9JCJ5	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	BCL2L11	O43521	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PAGE4	O60829	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	LTA	P01374	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		Q8N3U1	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	PTH2	Q96A98	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042		A0A1B0GV50	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KCNQ2-222	ENST00000636042	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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