RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 DAD1P61803 113 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 MUC21Q5SSG8 566 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 LYSTQ99698 3801 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SNURFLB1AK76 121 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB130BP0DP73 79 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB130AP0DP74 79 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 PPT1P50897 306 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TOR2AQ5JU69 321 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 UQCC3Q6UW78 93 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM210AQ96ND0 272 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLL5B9A064 214 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GCGP01275 180 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TDRG1Q3Y452 100 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 Q86TA4 180 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GNG13Q9P2W3 67 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 LCE6AA0A183 80 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 C9JQL5 133 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TCL1AP56279 114 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM183BQ1AE95 376 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SMUG1Q53HV7 270 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 FMC1Q96HJ9 113 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 MANBALQ9NQG1 85 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 MDFICQ9P1T7 246 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf21Q9P2W6 132 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 NAGKQ9UJ70 344 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GHRHP01286 108 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 HTN3P15516 51 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2G1P62253 170 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZTI0 123 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 APLNQ9ULZ1 77 aa8□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 RYR3Q15413 4870 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE12BA1L429 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM218A2RU14 115 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GNRH2O43555 120 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK4O60575 86 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE7O76087 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 LTAP01374 205 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TYMSP04818 313 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE12FP0CL80 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE12GP0CL81 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE12IP0CL82 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 AKR1C3P42330 323 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTAP57738 103 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5G1P05496 136 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ADCYAP1P18509 176 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 CRIP1P50238 77 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF415Q09FC8 603 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNS1Q96KK3 526 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 BCL2P10415 239 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 PEA15Q15121 130 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf52Q96A22 123 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 C18orf15Q96N68 181 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 DERL1Q9BUN8 251 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 F5H768 121 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA1P01562 189 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM210BQ96KR6 192 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL3L3-201ENST00000612839 MLST8Q9BVC4 326 aa7.96□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms