RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GATD1Q8NB37 220 aa6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BORCS7Q96B45 105 aa6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.65□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MUC4Q99102 2169 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A1B0GUT8 65 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 J3KRW8 73 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 M0R2Z0 102 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PHOX2AO14813 284 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGKV3-20P01619 116 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 S100A8P05109 93 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB5BP61020 215 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HBBP68871 147 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RIGQ13278 110 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KIR3DS1Q14943 382 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TDRG1Q3Y452 100 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DNLZQ5SXM8 178 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STHQ8IWL8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.64□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANK2Q01484 3957 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNURFLB1AK76 121 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 F2Z2F3 143 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNAI2O43623 268 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 INSP01308 110 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CD7P09564 240 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR5AL1P0C617 328 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF575Q86XF7 245 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KCNS1Q96KK3 526 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NAGKQ9UJ70 344 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 H3BVH4 76 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPINK4O60575 86 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRGC2P03986 189 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ASIPP42127 132 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q6ZQT7 251 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NACAE9PAV3 2078 aa6.62□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NXPH4O95158 308 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGLL1P15814 213 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CACNG7P62955 275 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MUC21Q5SSG8 566 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TPPP3Q9BW30 176 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BKO60814 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BJP06899 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BOP23527 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BBP33778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CAMPP49913 170 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FXYD7P58549 80 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BDP58876 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB4BP61018 213 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BCP62807 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRR31Q5SQ13 230 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FRZBQ92765 325 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.6□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLAQ13239 276 aa6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZFP82Q8N141 532 aa6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.59□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C9orf85Q96MD7 179 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms