RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A096LNJ9 63 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4-59P01825 116 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF185Q96GF1 192 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BUT2 72 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TM4SF20Q53R12 229 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR9Q5T870 116 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf118A6NHY6 69 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BRM9 83 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EDN2P20800 178 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLQO75417 2590 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BUA1 57 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRD5A1P18405 259 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNFNQ9BYD5 112 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A6NDN8 102 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EVI2AP22794 236 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP24Q9UPU5 2620 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM238C9JI98 176 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV1-40P01703 118 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIR3DS1Q14943 382 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 F6UB75 175 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TGFAP01135 160 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DSCR9P59020 149 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM208BQ5VWN6 2430 aa16.52■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7EP34 96 aa16.52■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.52■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB37Q96AX2 223 aa16.52■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WFDC3Q8IUB2 231 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0G2JLM5 398 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC25A16P16260 332 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CACNG7P62955 275 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DPF1Q92782 380 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 G3V4G9 280 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOCS3O14543 225 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRY2O43597 315 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COX6B1P14854 86 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPEQ02224 2701 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFHR3Q02985 330 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR10J6PQ8NGY7 276 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BRI3O95415 125 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GATA3P23771 443 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UFC1Q9Y3C8 167 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZANQ9Y493 2812 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BVH4 76 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSD52Q0P140 79 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNFRSF6BO95407 300 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HBDP02042 147 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A096LNT2 108 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF223E7ERA6 249 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa16.46■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa16.46■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NMUP48645 174 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP10-9P60411 292 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCP2Q8IVA1 136 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00477Q96M19 166 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C18orf15Q96N68 181 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRK2Q5S007 2527 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OVOL1O14753 267 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.44■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPCS1Q9Y6A9 102 aa16.44■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMPXQ9UHP9 88 aa16.44■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1W2PPM0 123 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSMB8P28062 276 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF843Q8N446 348 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 M0R381 172 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LEPP41159 167 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIVA1O15304 175 aa16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.4■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.4■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR5A1Q8NGJ0 315 aa16.4■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DKK2Q9UBU2 259 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms