RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 Q6AWC8 147 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1B0GVY2 172 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 F6UZH7 168 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00479Q96M42 142 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 C8orf49Q96NF6 230 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ARPC5O15511 151 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CXorf1O96002 111 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV2-11P01706 119 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 MBP02144 154 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CCL18P55774 89 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FHL2Q14192 279 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 LCE1DQ5T752 114 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TMED6Q8WW62 240 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ASB13Q8WXK3 278 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TREM1Q9NP99 234 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 NAGKQ9UJ70 344 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 A0A096LPF7 62 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 GGTLC3B5MD39 225 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TCRAP04437 139 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 SFTA3P0C7M3 94 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 UBE2G2P60604 165 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 C18orf15Q96N68 181 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 Q9H8V8 135 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 EPDR1Q9UM22 224 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 PSG8Q9UQ74 426 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TYMSP04818 313 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FHITP49789 147 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF415Q09FC8 603 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 PRNTQ86SH4 94 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF479Q96JC4 524 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 HERC2O95714 4834 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 H3BNG1 76 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CRYBA4P53673 196 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TDRG1Q3Y452 100 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 RASL10AQ92737 203 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1W2PRE2 83 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FAM74A7A6NL05 159 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TAAR5O14804 337 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 GCGP01275 180 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 SPXQ9BT56 116 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 C9JCJ5 164 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 IFNA7P01567 189 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CRIP1P50238 77 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 RNF151Q2KHN1 245 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 PRO0255Q9UI72 69 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 HMSDA8MTL9 139 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 K7EQM0 130 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 M0R2P5 195 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-211ENST00000581536 SMUG1Q53HV7 270 aa6.65□□□□□ -1.34
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