RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SCN3BQ9NY72 215 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 DOK5Q9P104 306 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 IFITM5A6NNB3 132 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RLN2P04090 185 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RD3LP0DJH9 198 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 HTR2BP41595 481 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LPAR6P43657 344 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 GALR1P47211 349 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 C15orf56Q8N910 161 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LINC01587Q99440 93 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 H7BYZ3 331 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 UPK1BO75841 260 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PTTG1O95997 202 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 OR10J1P30954 320 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 G6PCP35575 357 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP10-1P60331 282 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ESRGQ1W209 222 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 MPV17L2Q567V2 206 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 FAM78BQ5VT40 261 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF709Q8N972 641 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N9L7 120 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM243Q9BU79 118 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0J9YX75 114 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 GABARAPH6UMI1 98 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 GPR31O00270 319 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 IL4P05112 153 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 FXYD4P59646 89 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 IFITM3Q01628 133 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 IFT46Q9NQC8 304 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 SEC11BP0C7V7 166 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 AKR1C2P52895 323 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R20P59543 309 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TSPAN5P62079 268 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TAL2Q16559 108 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.35□□□□□ -1.87
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