RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	PAX4	O43316	350 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.94	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	SEC11B	P0C7V7	166 aa		12.93	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	CRYBA4	P53673	196 aa		12.93	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	NXPH4	O95158	308 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	IGHV3-53	P01767	116 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	FHL2	Q14192	279 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.92	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	FHIT	P49789	147 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF138	P52744	262 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	SLA	Q13239	276 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	ZFP69	Q49AA0	526 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390		Q8TAT8	98 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.91	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	RBAKDN	A6NC62	111 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	GNG5	P63218	68 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF415	Q09FC8	603 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	STOML3	Q8TAV4	291 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.9	□□□□□ -0.34
P4HB-223	ENST00000576390	UMAD1	C9J7I0	102 aa		12.89	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	UBE2G2	P60604	165 aa		12.89	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		12.89	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	C8orf49	Q96NF6	230 aa		12.89	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390		Q6AWC8	147 aa		12.88	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		12.88	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		12.88	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390		A0A1B0GV50	99 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SLC51B	Q86UW2	128 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	RASL10A	Q92737	203 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		12.87	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390		A0A1W2PRE2	83 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	GGTLC3	B5MD39	225 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.86	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390		K7EQD1	137 aa		12.85	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	ERVFC1-1	P60608	527 aa		12.85	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	NFE4	Q86UQ8	179 aa		12.85	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.85	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.85	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	TCRA	P04437	139 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35	3e-6	■□□□□ 10.8
P4HB-223	ENST00000576390	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SGK494	Q96LW2	274 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SPX	Q9BT56	116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		12.84	□□□□□ -0.35
P4HB-223	ENST00000576390	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	FAM74A7	A6NL05	159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390		K7EP13	123 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390		K7EQM0	130 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	EREG	O14944	169 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	IFNA7	P01567	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	XG	P55808	180 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	EPDR1	Q9UM22	224 aa		12.83	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	FAT1	Q14517	4588 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390		A0A087WTM6	91 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	SRI	P30626	198 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	EPM2A	B3EWF7	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	ORM1	P02763	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	SULT1A2	P50226	295 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	RAB5C	P51148	216 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	CST9LP1	Q5W188	147 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390		F6UZH7	168 aa		12.8	□□□□□ -0.36
P4HB-223	ENST00000576390	GYPE	P15421	78 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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