RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM210AQ96ND0 272 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLST8Q9BVC4 326 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF415Q09FC8 603 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOR2AQ5JU69 321 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHLRC2Q8NBF2 726 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf21Q9P2W6 132 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRIP1P50238 77 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB130BP0DP73 79 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB130AP0DP74 79 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM162BQ5T6X4 162 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV10A0A0B4J240 114 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM250H0YL14 139 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYMSP04818 313 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF674Q2M3X9 581 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDFICQ9P1T7 246 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNRH2O43555 120 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPWQ5EE01 88 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00612Q8N6U2 182 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D1AO60880 128 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG4P50150 75 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM12Q96EX1 92 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 STARD9Q9P2P6 4700 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB19A4D1S5 217 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPINK4O60575 86 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZTI0 123 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TENM2Q9NT68 2774 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORM1P02763 201 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS9BQ3B8N2 356 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPXQ9BT56 116 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE12BA1L429 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE7O76087 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE12FP0CL80 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE12GP0CL81 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE12IP0CL82 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV2-8P01709 118 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB14P61106 215 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARLQ9H300 379 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4DEV8 164 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR27Q6MZM9 219 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R036 132 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5G1P05496 136 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01559Q495D7 138 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRBOX1C9JBD0 128 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9JCJ5 164 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGST1P10620 155 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTN3P15516 51 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFITM2Q01629 132 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 C18orf15Q96N68 181 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEBPGP53567 150 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV2A0A075B6R0 118 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGPEP1LA6NFU8 196 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRP19P09132 144 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASIPP42127 132 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R2P5 195 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A4P26447 101 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASL10AQ92737 203 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf85Q96MD7 179 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIN3Q9NQY0 253 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLL5B9A064 214 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEA15Q15121 130 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMDT1Q9H4I9 107 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNLZQ5SXM8 178 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5I1Q13606 314 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLLU1Q5K131 121 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF575Q86XF7 245 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM210BQ96KR6 192 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL36BQ9NZH7 164 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 F5H768 121 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTAP57738 103 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM7Q9BQ49 75 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC4Q99102 2169 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIFINA4D1Z8 144 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf71A6NCJ1 209 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCC1Q8TAD7 63 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BVH4 76 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL1P09341 107 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL19P84098 196 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF876PQ49A33 203 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF727A8MUV8 499 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9JQL5 133 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTH2Q96A98 100 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 LY96Q9Y6Y9 160 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EN84 100 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF3Q9BU61 184 aa23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.7 ms