RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1W2PS18 150 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV2-8P01709 118 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF492Q9P255 531 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 V9GYV3 84 aa9.79□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 BUB3O43684 328 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 LTAP01374 205 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00479Q96M42 142 aa9.78□□□□□ -0.84
SPNS3-202ENST00000572078 DIRC3C9JPN6 131 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SLC17A3O00476 420 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 TRGC2P03986 189 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 PSG3Q16557 428 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 WDR73Q6P4I2 378 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 Q86TA4 180 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF575Q86XF7 245 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 U3KQE9 123 aa9.77□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 A8MWL6 223 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 P01737 135 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 CT83Q5H943 113 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 PSMG4Q5JS54 123 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 PRR27Q6MZM9 219 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 PRNTQ86SH4 94 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 GLMPQ8WWB7 406 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NUDT11Q96G61 164 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 C17orf77Q96MU5 243 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 MLST8Q9BVC4 326 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 PSG8Q9UQ74 426 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.76□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 C5orf52A6NGY3 159 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 MT-ND6P03923 174 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 P0DMU3 169 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 FAM231AP0DMU4 169 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 FAM231CP0DMU5 169 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 CT45A10P0DMU9 189 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB1P60022 68 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZR54 194 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 XCL2Q9UBD3 114 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.75□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 RBAKDNA6NC62 111 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 TRGC1P0CF51 173 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFA6P56556 154 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 RASL11AQ6T310 242 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 NACAE9PAV3 2078 aa9.74□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 FAM231BA6NCW3 169 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BKO60814 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BJP06899 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BOP23527 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BBP33778 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 AKR1D1P51857 326 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BDP58876 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BCP62807 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 TSKUQ8WUA8 353 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 FRZBQ92765 325 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 SGK494Q96LW2 274 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.73□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 XKRY2A2RUG3 117 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 H3BMM0 161 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV2-11P01706 119 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 S100A8P05109 93 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.72□□□□□ -0.85
SPNS3-202ENST00000572078 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms