RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM189	A5PLL7	270 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	SNURFL	B1AK76	121 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		C9JQL5	133 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ORM1	P02763	201 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB130B	P0DP73	79 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB130A	P0DP74	79 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GNG4	P50150	75 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	MUC7	Q8TAX7	377 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	DKK2	Q9UBU2	259 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	MUC4	Q99102	2169 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE7	O76087	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV2-8	P01709	118 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	HTN3	P15516	51 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	DAD1	P61803	113 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	OR5I1	Q13606	314 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	CLLU1	Q5K131	121 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZTC4	211 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		B4DEV8	164 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM250	H0YL14	139 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TCL1A	P56279	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	PEA15	Q15121	130 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZTI0	123 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	OCC1	Q8TAD7	63 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	LYRM9	A8MSI8	78 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		H3BVH4	76 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		K7EN84	100 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-53	P01767	116 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	KCNS1	Q96KK3	526 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744		C9JCJ5	164 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	GZMB	P10144	247 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	ASIP	P42127	132 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	LINC01559	Q495D7	138 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	COMMD7	Q86VX2	200 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPL4-208	ENST00000564744	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	SPINK4	O60575	86 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	SST	P61278	116 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	C9orf85	Q96MD7	179 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744		F5H768	121 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744		M0R2P5	195 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744		P01737	135 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	SFTA3	P0C7M3	94 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	ADIRF	Q15847	76 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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