RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 DTD1Q8TEA8 209 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ORAOV1Q8WV07 137 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 C16orf74Q96GX8 76 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM222Q9H0R3 208 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A22Q9H936 323 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ATP6V0CP27449 155 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 CDKN1BP46527 198 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 GALR1P47211 349 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF503Q96F45 646 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 C17orf77Q96MU5 243 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 RSG1Q9BU20 258 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 NAGKQ9UJ70 344 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 H7BYZ3 331 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 K7EP13 123 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP10-1P60331 282 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 COX19Q49B96 90 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF727A8MUV8 499 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 FAM229AH3BQW9 127 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SCGB1D2O95969 90 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 G0S2P27469 103 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 RNF182Q8N6D2 247 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SLC35E1Q96K37 410 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ATP5SQ99766 215 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 WFDC1Q9HC57 220 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf202A1L168 122 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 ESDP10768 282 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 Q6ZSN1 163 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 MANBALQ9NQG1 85 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SCGB1D1O95968 90 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SELENOTP62341 195 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 RHOBP62745 196 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 RBKSQ9H477 322 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 RAB11AP62491 216 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 HAMPP81172 84 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF738Q8NE65 137 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TRGV9Q99603 122 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE12BA1L429 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 H3BNG1 76 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SIVA1O15304 175 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE7O76087 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE12FP0CL80 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE12GP0CL81 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE12IP0CL82 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 HBG1P69891 147 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 HBG2P69892 147 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 A0A087WTM6 91 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 PPBPP02775 128 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GPR82Q96P67 336 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 VAMP8Q9BV40 100 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 A0A096LPF7 62 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 F6UZH7 168 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 CIDEAO60543 219 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 ORM2P19652 201 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 GCSHP23434 173 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-205ENST00000547715 FHITP49789 147 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms