RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF726P1Q15940 193 aa4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.29□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPANXCQ9NY87 97 aa4.29□□□□□ -1.72
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WW49 117 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRBV12-3P01733 135 aa4.28□□□□□ -1.72
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF575Q86XF7 245 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BLNKQ8WV28 456 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.28□□□□□ -1.72
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.28□□□□□ -1.72
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.27□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GX51 115 aa4.27□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf94C9JXX5 98 aa4.27□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RETNQ9HD89 108 aa4.27□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRIP30626 198 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFA6P56556 154 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PGPA6NDG6 321 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE12JA6NER3 117 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OVOL1O14753 267 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE7O76087 117 aa4.26□□□□□ -1.73
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE12IP0CL82 117 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE4Q13068 117 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB136Q30KP8 78 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STPG4Q8N801 248 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C3orf56Q8N813 242 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FXYD5Q96DB9 178 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RARRES2Q99969 163 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.26□□□□□ -1.73
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